读取和写入CSV文件#
Arrow支持读取和写入CSV文件中的列式数据。目前提供的功能如下:
多线程或单线程读取
自动解压缩输入文件(基于文件名扩展名,例如
my_data.csv.gz
)从CSV文件的第一行获取列名
列式类型推断并转换为以下类型之一:
null
、int64
、float64
、date32
、time32[s]
、timestamp[s]
、timestamp[ns]
、string
或binary
数据对
string
和binary
列进行机会性字典编码(默认禁用)检测各种空值拼写,例如
NaN
或#N/A
写入 CSV 文件,并提供选项以配置精确的输出格式
用法#
CSV 读取和写入功能可通过 pyarrow.csv
模块使用。在许多情况下,您只需调用 read_csv()
函数,并传入要读取的文件路径即可
>>> from pyarrow import csv
>>> fn = 'tips.csv.gz'
>>> table = csv.read_csv(fn)
>>> table
pyarrow.Table
total_bill: double
tip: double
sex: string
smoker: string
day: string
time: string
size: int64
>>> len(table)
244
>>> df = table.to_pandas()
>>> df.head()
total_bill tip sex smoker day time size
0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 2
1 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 3
2 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 3
3 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 2
4 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
要写入 CSV 文件,只需调用 write_csv()
函数,并传入 pyarrow.RecordBatch
或 pyarrow.Table
以及路径或类文件对象即可
>>> import pyarrow as pa
>>> import pyarrow.csv as csv
>>> csv.write_csv(table, "tips.csv")
>>> with pa.CompressedOutputStream("tips.csv.gz", "gzip") as out:
... csv.write_csv(table, out)
注意
写入器尚不支持所有 Arrow 类型。
自定义解析#
如果要更改读取结构异常的 CSV 文件的默认解析设置,则应创建 ParseOptions
实例并将其传递给 read_csv()
import pyarrow as pa
import pyarrow.csv as csv
table = csv.read_csv('tips.csv.gz', parse_options=csv.ParseOptions(
delimiter=";",
invalid_row_handler=skip_handler
))
可用的解析选项包括:
CSV 数据中分隔各个单元格的字符。 |
|
可选用于引用 CSV 值的字符(如果不允许引用,则为 False)。 |
|
引用的 CSV 值中的两个引号是否表示数据中的单个引号。 |
|
可选用于转义特殊字符的字符(如果不允许转义,则为 False)。 |
|
CSV 值中是否允许换行符。 |
|
CSV 输入中是否忽略空行。 |
|
无效行的可选处理器。 |
另请参阅
有关更多示例,请参阅 ParseOptions
。
自定义转换#
如果要更改 CSV 数据转换为 Arrow 类型和数据的方式,则应创建 ConvertOptions
实例并将其传递给 read_csv()
import pyarrow as pa
import pyarrow.csv as csv
table = csv.read_csv('tips.csv.gz', convert_options=csv.ConvertOptions(
column_types={
'total_bill': pa.decimal128(precision=10, scale=2),
'tip': pa.decimal128(precision=10, scale=2),
}
))
可用的转换选项包括:
是否检查字符串列的 UTF8 有效性。 |
|
显式地将列名映射到列类型。 |
|
表示数据中空值的字符串序列。 |
|
表示数据中真布尔值的字符串序列。 |
|
表示数据中假布尔值的字符串序列。 |
|
用作浮点数和小数数据中小数点的字符。 |
|
尝试推断或转换时间戳值时按顺序尝试的与 strptime() 兼容的格式字符串序列(也可以提供特殊值 ISO8601())。 |
|
字符串/二进制列是否可以具有空值。 |
|
带引号的值是否可以为空。 |
|
是否尝试自动对字符串/二进制数据进行字典编码。 |
|
用于 auto_dict_encode 的最大字典基数。 |
|
要包含在表中的列的名称。 |
|
如果为假,则 include_columns 中但在 CSV 文件中不存在的列将导致错误。 |
另请参阅
有关更多示例,请参阅 ConvertOptions
。
增量读取#
对于内存受限的环境,还可以使用 open_csv()
一次读取一个批次的 CSV 文件。
有一些注意事项
目前,增量读取器始终是单线程的(无论
ReadOptions.use_threads
如何)。类型推断是在第一个块上完成的,并且类型随后被冻结;为了确保推断出正确的类型,请将
ReadOptions.block_size
设置为足够大的值,或者使用ConvertOptions.column_types
显式设置所需的类型。
字符编码#
默认情况下,CSV 文件应使用 UTF8 编码。对于 binary
列,接受非 UTF8 数据。可以使用 ReadOptions
类更改编码
import pyarrow as pa
import pyarrow.csv as csv
table = csv.read_csv('tips.csv.gz', read_options=csv.ReadOptions(
column_names=["animals", "n_legs", "entry"],
skip_rows=1
))
可用的读取选项包括:
是否使用多个线程来加速读取。 |
|
从输入流中一次处理多少字节。 |
|
在列名(如果有)和 CSV 数据之前跳过的行数。 |
|
在列名之后跳过的行数。 |
|
目标表的列名。 |
|
如果 column_names 为空,是否自动生成列名。 |
|
编码:对象 |
另请参阅
有关更多示例,请参阅 ReadOptions
。
自定义写入#
如果要更改写入使用不同约定的 CSV 文件的默认写入设置,则可以创建 WriteOptions
实例并将其传递给 write_csv()
>>> import pyarrow as pa
>>> import pyarrow.csv as csv
>>> # Omit the header row (include_header=True is the default)
>>> options = csv.WriteOptions(include_header=False)
>>> csv.write_csv(table, "data.csv", options)
增量写入#
要一次写入一个批次的 CSV 文件,请创建一个 CSVWriter
。这需要输出(路径或类文件对象)、要写入的数据的架构,以及上面描述的可选写入选项
>>> import pyarrow as pa
>>> import pyarrow.csv as csv
>>> with csv.CSVWriter("data.csv", table.schema) as writer:
>>> writer.write_table(table)
性能#
由于 CSV 文件的结构,无法期望获得与读取专用二进制格式(如 Parquet)时相同的性能水平。但是,Arrow 努力减少读取 CSV 文件的开销。合理的预期是在性能优良的台式机或笔记本电脑上每核至少 100 MB/s(以源 CSV 字节为单位测量,而不是目标 Arrow 数据字节)。
可以通过 ReadOptions
类控制性能选项。多线程读取是默认设置,可实现最高性能,并有效地将工作负载分配到所有可用内核上。
注意
并发线程数由 Arrow 自动推断。您可以分别使用 cpu_count()
和 set_cpu_count()
函数检查和更改它。