Python 开发#
此页面提供适用于所有平台的通用 Python 开发指南和源代码构建说明。
编码风格#
我们遵循类似于 pandas 项目 的 PEP8 编码风格。要检查样式问题,请使用 Archery 子命令 lint
$ pip install -e "arrow/dev/archery[lint]"
$ archery lint --python
某些问题可以通过传递 --fix
选项来自动修复
$ archery lint --python --fix
Python 代码库还包含一些 C++ 文件。要修复这些文件中的格式,请添加 --clang-format
选项
$ archery lint --python --clang-format --fix
单元测试#
我们使用 pytest 来开发我们的单元测试套件。在构建项目(见下文)后,您可以像这样运行其单元测试
$ pushd arrow/python
$ python -m pytest pyarrow
$ popd
运行单元测试所需的软件包要求在 requirements-test.txt
中找到,如果需要,可以使用 pip install -r requirements-test.txt
安装。
如果您在尝试运行测试时遇到 pyarrow._lib
或其他 PyArrow 模块的导入错误,请运行 python -m pytest arrow/python/pyarrow
并检查是否正确安装了 pyarrow 的可编辑版本。
该项目为其测试套件提供了一些自定义命令行选项。例如,某些测试默认情况下是禁用的。要查看所有选项,请运行
$ python -m pytest pyarrow --help
并查找“自定义选项”部分。
注意
有一些低级测试直接用 C++ 编写。这些测试在 pyarrow/src/python_test.cc 中实现,但它们也封装在一个基于 pytest
的 测试模块 中,作为 PyArrow 测试套件的一部分自动运行。
测试组#
我们有许多使用 pytest 标记组合在一起的测试。其中一些默认情况下是禁用的。要启用测试组,请传递 --$GROUP_NAME
,例如 --parquet
。要禁用测试组,请在前面加上 disable
,例如 --disable-parquet
。要**仅**运行特定组的单元测试,请在前面加上 only-
,例如 --only-parquet
。
测试组目前包括
dataset
:Apache Arrow Dataset 测试flight
:Flight RPC 测试gandiva
:Gandiva 表达式编译器测试(使用 LLVM)hdfs
:使用 libhdfs 访问 Hadoop 文件系统的测试hypothesis
:使用hypothesis
模块生成随机测试用例的测试。请注意,由于 pytest 的一个特性,--hypothesis
不起作用,因此您必须传递--enable-hypothesis
large_memory
:需要大量系统 RAM 的测试orc
:Apache ORC 测试parquet
:Apache Parquet 测试s3
:Amazon S3 测试tensorflow
:涉及 TensorFlow 的测试
Doctest#
我们使用 doctest 检查文档字符串示例是否是最新的且正确的。您也可以在本地运行以下命令来执行此操作
$ pushd arrow/python
$ python -m pytest --doctest-modules
$ python -m pytest --doctest-modules path/to/module.py # checking single file
$ popd
用于 .py
文件或
$ pushd arrow/python
$ python -m pytest --doctest-cython
$ python -m pytest --doctest-cython path/to/module.pyx # checking single file
$ popd
用于 .pyx
和 .pxi
文件。在这种情况下,您还需要安装 pytest-cython 插件。
基准测试#
有关运行基准测试的信息,请参阅 基准测试。
在 Linux 和 macOS 上构建#
系统要求#
在 macOS 上,任何现代 XCode(6.4 或更高版本;当前版本为 13)或 Xcode 命令行工具(xcode-select --install
)都足够了。
在 Linux 上,对于本指南,我们至少需要 gcc 4.8 或 clang 3.7。您可以通过运行以下命令检查您的版本
$ gcc --version
如果系统编译器早于 gcc 4.8,则可以使用 $CC
和 $CXX
环境变量将其设置为较新版本
$ export CC=gcc-4.8
$ export CXX=g++-4.8
环境设置和构建#
首先,让我们克隆 Arrow git 仓库
$ git clone https://github.com/apache/arrow.git
引入测试数据并设置环境变量
$ pushd arrow
$ git submodule update --init
$ export PARQUET_TEST_DATA="${PWD}/cpp/submodules/parquet-testing/data"
$ export ARROW_TEST_DATA="${PWD}/testing/data"
$ popd
使用 Conda#
conda 包管理器允许安装 Arrow C++ 和 PyArrow 的构建时依赖项作为预构建二进制文件,这可以使 Arrow 开发更容易和更快。
让我们创建一个 conda 环境,其中包含来自 conda-forge 的所有 C++ 构建和 Python 依赖项,以针对 Python 3.10 进行开发
在 Linux 和 macOS 上
$ conda create -y -n pyarrow-dev -c conda-forge \
--file arrow/ci/conda_env_unix.txt \
--file arrow/ci/conda_env_cpp.txt \
--file arrow/ci/conda_env_python.txt \
--file arrow/ci/conda_env_gandiva.txt \
compilers \
python=3.10 \
pandas
截至 2019 年 1 月,在许多 Linux 发行版上需要 compilers
包才能使用来自 conda-forge 的包。
解决了这个问题后,您现在可以激活 conda 环境
$ conda activate pyarrow-dev
对于 Windows,请参阅下面的 在 Windows 上构建 部分。
我们需要设置一些环境变量,以让 Arrow 的构建系统了解我们的构建工具链
$ export ARROW_HOME=$CONDA_PREFIX
使用系统和捆绑依赖项#
警告
如果您使用 Anaconda 发行版或 Miniconda 安装了 Python,则目前无法使用基于 pip 的虚拟环境。请改为遵循基于 conda 的开发说明。
如果不使用 conda,则必须安排您的系统提供所需的构建工具和依赖项。请注意,如果某些依赖项不存在,Arrow C++ 构建链可能仍然能够动态下载和编译它们,但这将比使用预安装的二进制文件花费更长的时间。
在 macOS 上,使用 Homebrew 安装构建 Arrow C++ 所需的所有依赖项
$ brew update && brew bundle --file=arrow/cpp/Brewfile
请参阅 此处 以获取您可能需要的依赖项列表。
在 Debian/Ubuntu 上,您需要以下最少的依赖项集
$ sudo apt-get install build-essential ninja-build cmake python3-dev
现在,让我们在与存储库相同的文件夹中创建一个 Python 虚拟环境,并创建一个目标安装文件夹
$ python3 -m venv pyarrow-dev
$ source ./pyarrow-dev/bin/activate
$ pip install -r arrow/python/requirements-build.txt
$ # This is the folder where we will install the Arrow libraries during
$ # development
$ mkdir dist
如果您的 CMake 版本在 Linux 上太旧,您可以通过 pip install cmake
获取更新的版本。
我们需要设置一些环境变量,以让 Arrow 的构建系统了解我们的构建工具链
$ export ARROW_HOME=$(pwd)/dist
$ export LD_LIBRARY_PATH=$(pwd)/dist/lib:$LD_LIBRARY_PATH
$ export CMAKE_PREFIX_PATH=$ARROW_HOME:$CMAKE_PREFIX_PATH
构建和测试#
现在构建 Arrow C++ 库并将它们安装到我们在上面创建的目录中(存储在 $ARROW_HOME
中)
$ cmake -S arrow/cpp -B arrow/cpp/build \
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$ARROW_HOME \
--preset ninja-release-python
$ cmake --build arrow/cpp/build --target install
ninja-release-python
不是唯一可用的预设 - 如果您希望构建更多功能(如 CUDA、Flight 和 Gandiva 支持),您可以选择 ninja-release-python-maximal
预设。如果您想要更少的功能(即删除 ORC 和数据集支持),您可以选择 ninja-release-python-minimal
。在任何上述预设中将 release
更改为 debug
将生成 Arrow 的调试版本。
预设作为一种便利提供,但您也可以选择指定各个组件
可以通过使用 ON
添加标志来打开许多可选组件
ARROW_CUDA
:支持启用 CUDA 的 GPUARROW_DATASET
:支持 Apache Arrow DatasetARROW_FLIGHT
:Flight RPC 框架ARROW_GANDIVA
:基于 LLVM 的表达式编译器ARROW_ORC
:支持 Apache ORC 文件格式ARROW_PARQUET
:支持 Apache Parquet 文件格式PARQUET_REQUIRE_ENCRYPTION
:支持 Parquet 模块化加密
上面设置为 ON
的任何内容也可以关闭。请注意,建议使用一些压缩库来获得完整的 Parquet 支持。
您可以选择不同类型的 C++ 构建类型
-DCMAKE_BUILD_TYPE=Release
(默认值)生成启用优化且禁用调试信息的构建;-DCMAKE_BUILD_TYPE=Debug
生成禁用优化且启用调试信息的构建;-DCMAKE_BUILD_TYPE=RelWithDebInfo
生成同时启用优化和调试信息的构建。
另请参阅
如果您的环境中安装了多个版本的 Python,您可能需要向 CMake 传递其他参数,以便它可以找到正确的可执行文件、头文件和库。例如,指定 -DPython3_EXECUTABLE=<path/to/bin/python>
可以让 CMake 选择您正在使用的 Python 可执行文件。
注意
在支持在多个架构上构建的 Linux 系统上,make
可能会默认将库安装在 lib64
目录中。因此,我们建议传递 -DCMAKE_INSTALL_LIBDIR=lib
,因为 Python 构建脚本假设库目录为 lib
注意
如果您安装了 conda 但未使用它来管理依赖项,并且在构建 C++ 库时遇到问题,您可能需要设置 -DARROW_DEPENDENCY_SOURCE=AUTO
或其他值(此处 有描述),以明确告诉 CMake 不要使用 conda。
对于任何其他 C++ 构建挑战,请参阅 C++ 开发。
如果您可能需要由于过程中出现错误而重新构建 C++ 部分,建议使用命令 rm -rf arrow/cpp/build
删除构建文件夹。如果构建已成功完成,并且您需要由于从 git 主分支的最新拉取而重新构建,则不需要此步骤。
现在,构建 pyarrow
$ pushd arrow/python
$ export PYARROW_PARALLEL=4
$ python setup.py build_ext --inplace
$ popd
如果您在 C++ 中构建了可选组件之一,则默认情况下将为构建 pyarrow 启用等效组件。可以通过将相应的 PYARROW_WITH_$COMPONENT
环境变量设置为 0 或 1 来覆盖此默认值,请参阅下面 相关组件和环境变量。
要设置用于编译 PyArrow 的 C++/Cython 组件的线程数,请设置 PYARROW_PARALLEL
环境变量。
如果您希望在重新构建之前删除过时的 PyArrow 构建工件,请导航到 arrow/python
文件夹并运行 git clean -Xfd .
。
默认情况下,即使 Arrow C++ 已在调试模式下构建,PyArrow 也将在发布模式下构建。要创建 PyArrow 的调试版本,请在运行上述 python setup.py build_ext --inplace
之前运行 export PYARROW_BUILD_TYPE=debug
。可以类似地创建 relwithdebinfo
版本。
现在,您可以准备安装测试依赖项并运行 单元测试,如上所述。
要构建一个自包含的 wheel(包括 Arrow 和 Parquet C++ 库),可以设置 --bundle-arrow-cpp
$ pip install wheel # if not installed
$ python setup.py build_ext --build-type=$ARROW_BUILD_TYPE \
--bundle-arrow-cpp bdist_wheel
注意
要安装可编辑的 PyArrow 构建,请在 arrow/python
目录中运行 pip install -e . --no-build-isolation
。
Docker 示例#
如果您在从源代码构建 Python 库时遇到困难,请查看 python/examples/minimal_build
目录,该目录说明了使用 conda 和基于 pip 的构建方法从源代码进行完整构建和测试。
调试#
由于 pyarrow 依赖于 Arrow C++ 库,因此调试经常涉及 Python 和 C++ 共享库之间的交叉。为了获得最佳体验,请确保您已在调试模式下构建了 Arrow C++(-DCMAKE_BUILD_TYPE=Debug
)和 PyArrow(export PYARROW_BUILD_TYPE=debug
)。
在 Linux 上使用 gdb#
要使用 gdb 调试 C++ 库并在运行 Python 单元测试时,首先使用 gdb 启动 pytest
$ gdb --args python -m pytest pyarrow/tests/test_to_run.py -k $TEST_TO_MATCH
要设置断点,请使用与调试 C++ 程序时相同的 gdb 语法,例如
(gdb) b src/arrow/python/arrow_to_pandas.cc:1874
No source file named src/arrow/python/arrow_to_pandas.cc.
Make breakpoint pending on future shared library load? (y or [n]) y
Breakpoint 1 (src/arrow/python/arrow_to_pandas.cc:1874) pending.
另请参阅
在 Windows 上构建#
在 Windows 上构建需要安装以下编译器之一
Visual Studio 2017
在构建工具的设置过程中,请确保至少选择了一个 Windows SDK。
我们引导一个类似于上述的 conda 环境,但跳过了一些仅限 Linux/macOS 的包
首先,从 Apache Arrow 的全新克隆开始
$ git clone https://github.com/apache/arrow.git
$ conda create -y -n pyarrow-dev -c conda-forge ^
--file arrow\ci\conda_env_cpp.txt ^
--file arrow\ci\conda_env_python.txt ^
--file arrow\ci\conda_env_gandiva.txt ^
python=3.10
$ conda activate pyarrow-dev
现在,我们构建并安装 Arrow C++ 库。
我们将 Arrow C++ 库的安装目录路径设置为 ARROW_HOME
。在使用 conda 环境时,Arrow C++ 安装在环境目录中,该目录的路径保存在 CONDA_PREFIX 环境变量中。
$ set ARROW_HOME=%CONDA_PREFIX%\Library
让我们配置、构建和安装 Arrow C++ 库
$ mkdir arrow\cpp\build
$ pushd arrow\cpp\build
$ cmake -G "Ninja" ^
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=%ARROW_HOME% ^
-DCMAKE_UNITY_BUILD=ON ^
-DARROW_COMPUTE=ON ^
-DARROW_CSV=ON ^
-DARROW_CXXFLAGS="/WX /MP" ^
-DARROW_DATASET=ON ^
-DARROW_FILESYSTEM=ON ^
-DARROW_HDFS=ON ^
-DARROW_JSON=ON ^
-DARROW_PARQUET=ON ^
-DARROW_WITH_LZ4=ON ^
-DARROW_WITH_SNAPPY=ON ^
-DARROW_WITH_ZLIB=ON ^
-DARROW_WITH_ZSTD=ON ^
..
$ cmake --build . --target install --config Release
$ popd
现在,我们可以构建 pyarrow 了
$ pushd arrow\python
$ set CONDA_DLL_SEARCH_MODIFICATION_ENABLE=1
$ python setup.py build_ext --inplace
$ popd
注意
对于构建 pyarrow,还需要设置上述定义的环境变量。如果您想在初始构建后重新构建 pyarrow
,请记住这一点。
注意
如果您使用的是 Python 3.9 或更早版本的 Conda,则必须设置 CONDA_DLL_SEARCH_MODIFICATION_ENABLE=1
。
然后使用以下命令运行单元测试
$ pushd arrow\python
$ python -m pytest pyarrow
$ popd
注意
按照上述说明,Arrow C++ 库不会与 Python 扩展捆绑在一起。这对于开发来说是推荐的做法,因为它允许单独重新构建 C++ 库。
如果您使用的是 conda 包管理器,则 conda 将确保找到 Arrow C++ 库。如果您 *不* 使用 conda,则必须
每次在导入
pyarrow
之前都将已安装的 DLL 库的路径添加到PATH
中,或者将 Arrow C++ 库与
pyarrow
捆绑在一起。
如果您想将 Arrow C++ 库与 pyarrow
捆绑在一起,请在构建 pyarrow
之前设置 PYARROW_BUNDLE_ARROW_CPP
环境变量
$ set PYARROW_BUNDLE_ARROW_CPP=1
$ python setup.py build_ext --inplace
请注意,在重新构建 Arrow C++ 时,捆绑的 Arrow C++ 库不会自动更新。
注意事项#
相关组件和环境变量#
可用于构建 PyArrow 的相关环境变量列表
PyArrow 环境变量 |
描述 |
默认值 |
---|---|---|
|
PyArrow 的构建类型(release、debug 或 relwithdebinfo),设置 |
|
|
例如: |
|
|
额外的 CMake 和 Arrow 选项(例如 |
|
|
额外的 C++ 编译器标志 |
|
|
为 Cython 编译器设置 |
|
|
捆绑 Arrow C++ 库 |
|
|
捆绑 Cython 生成的 C++ 文件 |
|
|
启用 Makefile 构建的详细输出 |
|
|
用于编译 PyArrow 的 C++/Cython 组件的进程数 |
|
构建 PyArrrow 时禁用或启用组件默认基于 Arrow C++ 的构建方式(即遵循 ARROW_$COMPONENT
标志)。但是,在构建 PyArrow 时,仍然可以使用 PYARROW_WITH_$COMPONENT
环境变量来覆盖此设置(例如,禁用组件或强制构建某些组件)。
Arrow 标志/选项 |
PyArrow 的对应环境变量 |
---|---|
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|
|
删除过时的构建工件#
当 Arrow C++ 库或 PyArrow 的结构发生变化时,建议彻底清理作为解决构建错误的第一步尝试。
注意
从错误本身不一定能直观地看出问题是由于过时的工件造成的。过时的工件导致的构建错误示例是“未知的 CMake 命令“arrow_keep_backward_compatibility””。
要删除过时的 Arrow C++ 构建工件
$ rm -rf arrow/cpp/build
要删除过时的 PyArrow 构建工件
$ git clean -Xfd python
如果使用 Conda 环境,则某些构建工件会安装在 $ARROW_HOME
(也称为 $CONDA_PREFIX
)中。例如,$ARROW_HOME/lib/cmake/Arrow*
、$ARROW_HOME/include/arrow
、$ARROW_HOME/lib/libarrow*
等。
可以手动删除这些文件。如果不确定要删除哪些文件,一种方法是重新创建 Conda 环境。
或者删除当前环境,并重新开始
$ conda deactivate
$ conda remove -n pyarrow-dev
或者,不那么破坏性地,创建一个具有不同名称的不同环境。
安装每日构建包#
警告
这些包不是正式发布的版本。使用它们需自行承担风险。
PyArrow 具有用于测试目的的每日构建轮子和 Conda 包。
这些可能适合其持续集成设置中的下游库,以保持与即将推出的 PyArrow 功能、弃用和/或功能删除的兼容性。
从 arrow-nightlies conda 频道安装 PyArrow 的开发版本
conda install -c arrow-nightlies pyarrow
请注意,这需要对所有其他包使用 conda-forge
频道(conda config --add channels conda-forge
)。
从 备用 PyPI 索引安装开发版本
pip install --extra-index-url https://pypi.fury.io/arrow-nightlies/ \
--prefer-binary --pre pyarrow